Im Toggenburger Museum finden sich in 11 Räumen auf zwei Stockwerken eine Auswahl wesentlicher Objekte zur Volkskunde sowie zur Kultur- und Wirtschaftsgeschiche des Toggenburgs.

Kunst und Künstler aus dem Thur- und Neckertal, Musikinstrumente, Textilien und Militaria sind dabei ebenso vertreten wie Exponate zur bäuerlichen Malerei und Volkskunst sowie Wohnkultur und Kunstgewerbe.
Einen besonderen Stellenwert nehmen drei Toggenburger Persönlichkeiten von weltweiter Bedeutung ein, nämlich der Uhrmacher und Astronom Jost Bürgi, der Reformator Huldrych Zwingli sowie der Garnhändler, Reisläufer und Schriftsteller Ulrich Bräker. 

Regelmässig (ein bis zweimal jährlich) finden Sonderausstellungen zu ausgewählten Themen im Sous-sol des Museumsgebäudes statt, die auch überregional viel Beachtung finden.

Das Toggenburger Museum figuriert auch als Dokumentations- und wissenschaftliche Auskunftsstelle. Es verfügt in seiner Bibliothek über einen grossen Bestand an Publikationen zur Ortsgeschichte, zur Natur und Kultur des Toggenburgs, Vereinsbroschüren sowie Dokumenten und Werbematerial, die der Forschung und für Publikationen zur Verfügung stehen.

Das umfangreiche Archiv des verstorbenen Genealogen Jakob Wickli kann uneingeschränkt für die Familienforschung benutzt werden (Sammelgebiet beschränkt auf toggenburgische Geschlechter und Familien).